FC Carl Zeiss Jena alebo celým menom Fußballclub Carl Zeiss Jena e.V. je futbalový klub z nemeckého mesta Jena. FC Carl Zeiss Jena bol založený 13. mája 1903. V časoch Východného Nemecka klub vyhral tri ligové tituly a štyrikrát národný pohár. V súčasnosti hrá tretiu najvyššiu nemeckú futbalovú súťaž.